[Iska]

Да, часто бывает метод типа Update(byte []), которому можно по кускам скармливать... »

Нет, тут я как раз напрямую говорю — мы не считаем хэш всего файла. Мы считаем хэши мелких кусков, склеиваем их в одну переменную (хоть массивом байт, хоть строкой) и ещё раз считаем хэш, теперь уже этого полученного набора. В авторском случае неважно считать хэш на весь файл или таким вот макаром. Хотя для самой задачи обновления давно есть решение — MSI.