[m0nkrus]

Отредактировать MSI пакет, отключив создание пункта удаления приложения в "Программы и компоненты", например, с помощью ORCA, не вариант?

Не вариант. Нужно оставить всю установочную конструкцию нетронутой. Только внешнее дополнение.

Только не совсем понятно для чего скрывать, ведь отсутствие этого пункта (записи в реестре), не влияет на деинсталляцию приложения

Я делаю сборник из нескольких программ. Удаление там реализовано как общий механизм удаления всего пакета программ с выбором подпунктов для удаления. Хочу избавить конечного юзера он лицезрения дублирующих пунктов удаления в "Программы и компоненты".