[Iska]

но нет ли более простых способов, чем использование таких больших программ »

Именно так:

Нашёл в интернете способ замены этих файлов, но не в режиме операционки, а по консоли с установочного диска Windows »

Консоль восстановления с оригинального инсталляционного диска. Но это не «командная строка». Возможности консоли восстановления ограничены, но для проведения операции замены файлов методом копирования из файлов точки восстановления вполне достаточны — оригинальная ссылка на материал эта: How to recover from a corrupted registry that prevents Windows XP from starting. Я подобный метод пользовал, он работает.

Вот только как - непонятно, подскажите пожалуйста. Файла резервной копии реестра в виде *.reg нету. Только вышеупомянутые файлы реестра без расширения (default, sam, default, security, system). »

См. раздел «Кусты» статьи: Архитектура системного реестра. Часть 2.