[Den30lv]

Не очень хорошая идея положить папку с именем "ico" в системную папку. »

Полностью согласен.
В прошлых конструкторах я правил файлы Akelpad4.nsi и Akelpad.nsi для добавления нужных мне файлов (в частности деинсталлятора), а в новой версии конструктора не вижу, что править.

что мешает разместить папку ico внутри AkelFiles? »

В данном конкретном случае то, что пути ко всем иконкам прописаны именно к system32\ico.

---

SharkyEXE,
Посмотрите, может отсюда что-то подойдёт.