[pogo]

%APPDATA%\Microsoft\Internet Explorer\Quick Launch\User Pinned\TaskBar »

По данному пути, есть все иконки с панели задач, кроме магазина.

Вроде как решение нашёл частичное решение проблема:
1. Скопировать в \\%домен%\SYSVOL\%домен%\Policies\PolicyDefinitions\ файл Taskbar.admx из C:\Windows\PolicyDefinitions локального компьютера с установленной Windows 8.1 Update1.
2. Скопировать в \\%домен%\SYSVOL\%домен%\Policies\PolicyDefinitions\en-us и \\%домен%\SYSVOL\%домен%\Policies\PolicyDefinitions\ru-ru файлы из C:\Windows\PolicyDefinitions\en-us и C:\Windows\PolicyDefinitions\ru-ru соответственно.
3. После чего в групповых политиках появится: Конфигурация пользователя -> Политики -> Административные шаблоны -> Меню "Пуск" и панель задач -> Показывать приложение Магазин на панели задач, которое надо отключить.

После чего в "Свойства панели задач и навигации" галочка "Показывать приложения Магазина Windows на панели задач" стала неактивной, но значёк магазина с панели задач не пропал, хотя сам Магазин стал отключен и недоступен.

Так что вопрос остаётся открытым..