Win-Hacker, возможно, с файлами проблем и не будет (хотя разным версиям программы могут быть нужны и файлы разных версий),
проблема будет в реестре, когда ключи с одинаковыми названиями должны будут иметь разные значения.
Возможно, вам подойдет
этот вариант?
Там хоть 10 разных версий можно запустить.
