[olen6]

У кого то получилось установить Windows 8.1 Pro на флешку? »

Мой ответ не полностью совпадает с вашим вопросом. Получилось, но не Pro версию (её не оказалось под рукой), а Windows 8.1 SL.
Установка на флешку SanDisk Extreme 64Gb.

И второй вопрос. У кого то получалось обновить Windows 8 Pro, установленную на флешку? Имеется в виду Windows Update, получить и установить обновления для ОС. »

И второй мой ответ немного не в тему (нет под рукой 8 Pro), но обновления скачиваются и устанавливаются на указанную выше Windows 8.1 SL, на флешку.
Может быть мои ответы натолкнут вас на путь решения вашей проблемы.

Добавлено: Судя по приведённой вами команде bcdboot e:\windows /s e: /f ALL, загрузочные файлы вы хотите разместить на одном разделе с переносной Windows, а значит у вас не UEFI система. Исходя из этого, можно попробовать слегка изменить команду так bcdboot e:\windows /s e: /f bios, а если нужен русский язык, то так bcdboot e:\windows /l ru-ru /s e: /f bios