[Instant_SR]

Я сам недавно искал способ создания ярлыка через .*bat но в конце концов поиски увенчались реализацией:
.bat открывает .vbs - .vbs создает ярлык:
.bat

Код:

cscript.exe //nologo "\\path\script.vbs"

.vbs

Код:

Option Explicit
With WScript.CreateObject("WScript.Shell").CreateShortcut(WScript.CreateObject("Shell.Application").NameSpace("shell:desktop").self.Path & "\shortcut.lnk")
	.TargetPath   = "C:\path\programm.exe"
	.Save
End With
WScript.Quit 0

Если интересует только изменение, то скрипт при создании ярлыка перезаписывает предыдущий с таким же названием. Т.е. все изменения в .vbs делаются