[AMDBulldozer]

Имеет ли смысл отключить большую часть выполняемых параллельно процессов, а оставшиеся - перебросить на одно ядро »

Нет, не имело бы. Единственный способ увеличить скорость исполнения это писать более эффективные наборы команд. Например, научиться, если Вы еще не умеете, правильно использовать функцию Parallelize и почаще её использовать. Поскольку самые вроде бы легко распараллеливаемые вычисления, вроде вычислений факториала натурального числа или сумм исполняются в один поток.
Кроме того, по возможности чаще использовать при последующих вычислениях результаты предыдущих. Вероятно Вы обращали внимание, что повторное вычисление всегда происходит очень быстро - Mathematica не повторяет расчеты, а сразу берет готовый результат, несмотря на то, что Вы его в явном виде не сохранили ни в какой переменной.
К тому же, Вам грех жаловаться. В начале 90-х простейшие квантовомеханические расчеты на Intel 80386 занимали полный рабочий день.