[yurfed]

и копировании данных с флешки на HDD »

Проверьте режим работы винчестера DMA или PIO
Удалите все любые драйверы от Intel, AMD, VIA, SiS и прочих чипсетов. Выставьте все драйверы IDE на стандартные от Microsoft.
Проверьте винчестер на ошибки с помощью Victoria. Выложите SMART диска.
Образ загрузочного диска для проверки
(Качайте ISO образ для ДОС, переключайтесь в БИОСе на SATA или IDE режимы, иначе диск не определится в программе.
Пробуйте другую флешку. Заряжайте её в задние разъёмы материнки.