[Гуллипут]

Да, Iska прав. Суть тут вот в чём: надо, чтобы первое включение >> воспринималось, как строка, а не как управляющая последовательность. Для этого служит специальный символ ^, который указывает, что следующий за ним символ не должен восприниматься, как управляющий. Но, кроме этого, видимо, надо, чтобы и первое включение знака % (вокруг x) тоже воспринималось, как текст. Для знака % это произойдёт, если его записать дважды. Так что это будет выглядеть так:

Код:

@echo @echo set /a f=e+1^>^>%%x%%>>%y%

Впрочем, последний мой вывод следует вот из этих слов:

переменные x и y содержат пути, мне необходимо, что бы во 2 bat файл записывались вот эти строки: @echo set /a f=e+1>>%x%

Если на самом деле имелось в виду, что во 2-ом файле должно быть уже значение переменной x, а не ссылка на неё, то нужен вариант, который предложил Iska. А это вполне вероятно в том случае, если переменная x определена только внутри 1-го файла.