[K.A.V.]

Скажите, пожалуйста, куда и что нужно прописать в исходнике и добавить в программу, чтобы задать степень прозрачности окна (любого) и задать всплывающие подсказки к элементам? »

Надеюсь, вы про сам SFX Creator?

Идём в файл \SYS\Settings.ini, секция Options
1. Степень прозрачности окон SFX Creator регулируется параметром Transparent
Допустимые значения: от 10 до 100, обратите внимание, что SFX Creator примет только значения десятков (10, 20, 30 и т.д. до 100)

2. Всплывающие подсказки к элементам? Если вы про те, которые показываются только в главном окне программы, то включить/отключить их можно управляя значением параметра ToolTips
Допустимые значения: 0 - отключить, отсутствие или другое значение параметра включает отображение подсказок