[El Sanchez]

Не известно какой установщик используется у Mat_y, тем более как он указывает что не его »

Nordek, понятно, что это Inno, ибо сие...

Если воспользоваться Unninst.exe, то все дополненные файлы удаляются как надо, но и по AppId установщик эту программу перестает находить »

...возможно только в одном случае, когда патч имеет с программой одинаковый AppId (причем этот AppId именно Inno-шный, с приставкой _isцифра), при установке перезаписывает ветку регистрации программы, а при удалении благополучно ее сносит. Поэтому повторный запуск патча программу уже не найдет.

Ну совсем не помогло... я думаю надо что-то писать в секцию [Registry] »

Mat_y, не можете придумать отличный от AppId программы AppId патча? Тогда ветку регистрации программы из реестра, секцию Setup из скрипта патча и реализацию нахождения AppId программы в студию.