[chuSS]

У вас было 2 системы на 2-х дисках, обе загружались... Как? С меню или без?

Да, было две. Меню не было. Загружался выбирая при загрузке хард (F12 BIOS фича). Дэфолтом шла загрузка со второго винта.

Значит сейчас вы можете загрузиться в систему на втором диске? С подключенным первым или без?

Да, после обновления ос на втором харде, я могу загружаться только с него, с подключенным первым или без.

Почему спрашиваю? Потому что самый первый файл у вас был с одним диском из четырех разделов. Файл, как я понимаю, вы получили из среды Windows RE?

Все правильно, диск с четырьмя разделами - это первый. С него и не могу загружаться.
И да, загрузился с флешки, т.к. добраться к консоли загрузившись с диска нет возможности (описывал выше), могу зайти в консоль загрузившись с установочного DVD, - но программа MultiBoot с нее не стартует, пишет чего-то не хватает.