Еще возможна такая ситуация - NTFS резервирует определенное пространство на ЖД под свои нужды - системный файл который описывает всю файловую систему, обычно он резервируется в процентном отношении от объема диска, отсюда и 2 пропавших га.
Но на счет неразмеченных областей проверьте, как посоветовал
McDAK все же в первую очередь
.
