[kotkovets]

ибо не понятно, откуда программе узнать что юзер ее запускает с ключом »

С помощью переменной $CMDLINE ну а дальше разбор строки:
заведи с ключом /key ..

Код:

!include "FileFunc.nsh"
!include "LogicLib.nsh"

outfile test.exe

Section

  ClearErrors
  ${GetOptions} "$CMDLINE" "/key"  $R0
  ${IfNot} ${Errors}

    MessageBox MB_OK "Запуск с ключом: /key" IDOK

  ${EndIf}

SectionEnd

схема работает на основе флага ошибки, поэтому для определения другога (следующего) ключа,
нужно сбрасывать флаг ошибки командой ClearErrors