[Kvazar]

В общем Vahe оказался прав - матрешка действительно имеет странные проблемы с задержкой звука (delay). Как таковая задержка работает нормально - т.е. звук смещается в времени, но возникают глюки при разрезании видео-файла на отдельные фрагменты. Сейчас пытался разрезать готовый фильм "Видок" с двумя звуковыми дорожками АС3 на два диска - звук синхронизируется идеально (у одной дорожки delay 9538ms), но при завершении процесса сохранения Даб вываливается с ошибкой. Дальше больше - во втором сегменте в начале нет звука на протяжении пары минут, дальше звук появляется. Сохранил все это дело в AVI - никаких ошибок и звук во втором сегменте появляется сразу.
И еще одна удивительнейшая вещь. Перемотка в MKV ощутимо более тормознутая, чем в AVI. В любом случае я сейчас делаю все фильмы с АС3 звуком минимум на 2 диска, поэтому скорее всего вернусь обратно к AVI, интерлив правда увеличится на 5-8 Mb.