Сильно похоже на то, что IIS работает в режиме совместимости с 32-битными приложениями.
Попробуйте переключить его в 64-битный режим.
Код:
cscript c:\inetpub\adminscripts\adsutil.vbs SET /w3svc/AppPools/Enable32BitAppOnWin64 False
Так же рекомендую установить все последние обновления на OS.
