на случай, если еще кто будет помирать от неизвестности
относительный путь:
php_value include_path ../lib/php-lib:../include
php_value auto_prepend_file ../lib/php-lib/prepend.php3
спас великую Германию от неминуемого провала
Фишка была в следующем: там какой-то кривой то ли jail, то ли еще какой chroot при котром / скриптами, а главное сервером не воспринимается за корень. Раньше, столкнувшись с этим, я вытянула полный путь из логов папочки /log, чем благополучно и пользовалась, а тут что-то там у них в путях, или у меня в голове переклинило. 
В общем - проект сдавать скоро - начинается визит-эффект ))
