[Iska]

При помощи WMI удаленно создается процесс, висит в таск менеджере, но само окошечко программы не появляется. »

И не появится.

Create method of the Win32_Process class (Windows):

Windows 2000 Professional with SP2 and earlier, Windows NT, and Windows 98/95: Win32_Process.Create can create an interactive process remotely.

От Windows XP и выше — не выйдет.

Как это можно решить? »

В рамках данной методики — никак. Если надо остаться в рамках Wbem — используйте старый дедовский способ: создание задания посредством Win32_ScheduledJob/at.exe, отсрочив его однократный запуск на минуту.