[Georgio]

Liquid Ocelot,
примерно так:

Код:

SET VAR1="%%J\setup.txt"
SETLOCAL ENABLEDELAYEDEXPANSION
FOR /F "skip=2 tokens=1,2* delims=[]/" %%I IN ('FIND /N " " ADBook.txt') DO (
IF NOT EXIST "%%J" MD "%%J"
ECHO Username=%%J/%%K>%VAR1%
SET /A VAR2=%%I+1
FOR /F "skip=2 tokens=1* delims=[]" %%L IN ('FIND /N "." ADBook.txt') DO (
IF %%L==!VAR2! ECHO KeyfileName=C:\IBM\Lotus\Notes\Data\%%M>>%VAR1%&&^
ECHO Domino.Name=server>>%VAR1%&&^
ECHO Domino.Server=^1>>%VAR1%&&^
ECHO AdditionalServices=-1>>%VAR1%&&^
ECHO IM.Server=fakeservername>>%VAR1%&&^
ECHO IM.Port=80>>%VAR1%&&^
ECHO IM.Protocol=^1>>%VAR1%
))
PAUSE

Данные из Template.txt в теле скрипта, т. е. для тестирования Template.txt не нужен.

Если что не так, попробуем доработать.