[Fikys]

решения так и не нашёл »

По непроверенным мною лично данным, нужно всего лишь отключить быструю загрузку (fast boot) в Windows 8. Как это сделать можно прочесть например здесь.
Исходя из этой информации

Обратите внимание, что быстрый запуск параметр не применяется для перезагрузки. Если вы перезагружаете Windows 8, она проходит полный (не быстрый) цикл запуска системы, который может происходить медленнее, чем включение/выключение системы.

я задним числом припоминаю, что проблема с chkdsk возникла как раз после того, как я выключил компьютер и после включения загрузил семёрку. Пока же я переключался между системами после перезагрузки, проблем не было.