[sov44]

Код:

@Echo Off
SetLocal enabledelayedexpansion

echo 1 - копировать настройки на ПК
echo 2 - копировать настройки на сервер

:n1
Set /p choice="Ваш выбор: "
if not defined choice goto n1
if "%choice%"=="1" (rd /s/q "%AppData%\Mozilla\Firefox"&& copy /y Firefox "%AppData%\Mozilla\"& goto n2)
if "%choice%"=="2" (rd /s/q Firefox&& copy /y "%AppData%\Mozilla\Firefox" "%~dp0"& goto n2)
Echo Не правильно сделан выбор задания& goto n1

:n2
echo Задание %choice% выполнено
pause
exit /b

не проверено.