[AltY]

onis,
В общем, нормально. Недочёты, в основном, косметические.
1) Лучше удалять информация о заменённых апдейтах в RUSUPPCK.inf и, соответственно, удалять их каталоги (следовательно, для обновления с прошлого набора нужен файл upd (см. у simplix))
Вот, например, KB958687 заменяет KB957095 (srv.sys)
2) В RUSUPPCK.inf (секция с %SP4Updates%) незачем оставлять "хвосты" в виде указания размещения прошлых/разных версий файлов

Код:

HKLM,"%SP4Updates%\KB954600\Filelist\1","Location",0x0,"%11%\DllCache"
HKLM,"%SP4Updates%\KB954600\Filelist\2","Location",0x0,"%10%\$hf_mig$\KB954600\SP3GDR"
HKLM,"%SP4Updates%\KB954600\Filelist\3","Location",0x0,"%10%\$hf_mig$\KB954600\SP3QFE"

достаточно оставить то, что реально есть в сборке с интегрированным UP

Код:

HKLM,"%SP4Updates%\KB954600\Filelist\0","Location",0x0,"%11%"

3)

Код:

"InstalledBy",0x0,"SYSTEM"

И совет: ипользуйте RegShot, а также проверяйте, есть ли дополнительные данные в SP2QFE.inf (именно оттуда нужно их брать или смотреть и искать то же самое в системе)
Также предупреждаю, что хватает хлопот с [TimeZones.AddReg], если искать только то, что заносит обновление, а не лениво импортировать куст с "живой" системы.