[Iska]

По поводу объекта «Shell.Application»: как правило, его методы асинхронны — он не ждёт завершения исполнения метода. Под старые ОС были обходные пути, позволяющие скрипту «сидеть и ждать», например, открытия окна Проводника, под нонешними вроде как сие больше не работает.

По поводу метода «.Run()» объекта «WScript.Shell»: метод синхронен, т.е. исполнение скрипта не продолжится, пока метод не будет исполнен. Однако, то, что метод исполнен, отнюдь не означает, что, например, здесь:

Код:

With WScript.CreateObject("WScript.Shell")
	.Run "Photoshop.exe"
	.Run "notepad.exe"
End With

окно Photoshop'а появится на экране раньше, нежели окно Блокнота, скорее наоборот. Ибо Photoshop, по сравнению с Блокнотом весьма и весьма «тяжеловесное» приложение.

Я понимаю, Вас как раз интересует определённый порядок расположения (наложения, «z-order») окон Проводника и запускаемых приложений, так?