[CyraxZ]

Что здесь: F9, Параметры, Системные параметры:

"Снимать атрибут R/O c CD файлов" - галка стоит
"Удалять в корзину" - галка снята (да это и не нужно, т.к. в свойствах корзины я указал, чтобы файлы удалялись сразу, минуя корзину)
"Удалять символические ссылки" - такой опции в Системных параметрах у меня нет (версия Far: 1.70 beta 5 build 1634)
"Использовать системную функцию копирования" - галка снята

Что с параметром «Уничтожать файлы сразу после удаления, не помещая их в корзину» в свойствах Корзины?

В свойствах корзины я указал, чтобы файлы удалялись сразу, минуя корзину.
В итоге корзина всегда пустая.

Эти диски на одной и той же машине?

Первые 2 диска, на которых работал до недавнего времени, стояли на одной машине (других дисков на этой машине не было)
Сейчас перешёл на другую машину с другим (3-м) диском - на этом диске тоже наблюдаю такую ситуацию (где-то в 20-30% случаев место не освобождается). Far на этой машине тот же самый, что был на первой (с теми же настройками) - я его просто копирую и применяю настройки без всяких инсталляций.

«Shift-Del». «Alt-Del» — это wipe, уничтожение файла.

В Far'е удаляю файлы всегда Del'ом (без Alt'ов и Shift'ов).
Корзина пустая (как и всегда). Специально проверил на всякий.