[SergAS70]

Wandarnem, Вы учитываете что - в отличие от принятой в информатике системы приставок, обозначающих кратную 1024 величину (см.: двоичные приставки), производителями при обозначении ёмкости жёстких дисков используются величины, кратные 1000. Так, ёмкость жёсткого диска, маркированного как «200 ГБ», составляет 186,2 ГиБ.
Чем смотрели размеры каталогов, проводником? Отображать скрытые файлы и каталоги включено? В этом плане все удобно смотреть в Total commander. Пробелом выделяете каталог и тут-же видите сколько он занимает. Также есть возможность все подсчитать..
Надеюсь каталог System Volume Information тоже учитываете?, в зависимости от настроек параметров восстановления он может распухать значительно. И так-же имейте ввиду что файл-система создает теневой кешь-каталог для ускорения обращений к файлам (он единственный кто не виден в тотале). Он может занимать от 2 до 12гб в зависимости от количества мелких файлов.
Еще в редких случаях бывает сбой файл-системы, проверьте check диском.