[morebeauty]

Punto Switcher не люблю, т.к. часто переключается, когда мне не нужно. »

Отключите «Автопереключение». »

Верный совет. Прога полезная с одной лишь вредной функцией "Автопереключение", которая убирается в настройках.

Некоторые программы ломают переключение между языками ввода »

А программа ICQ 7 версии не установлена случаем? Одна из кривых версий аськи ломала переключалку, помню...
Если это так, установи новую версию ICQ или альтернативу QIP.

Можно ли что-нибудь с этим поделать (кроме как отказаться от использования этих программ)? »

Есть утилиты, которые в тч умеют отслеживать и логировать события, происходящие в системе (подробнее чем встроенные). Может, кто из пользователей подскажет такую утилиту.
Ну а если нет, то Панель управления---Администрирование---Просмотр событий. Там тебя интересуют ветки Приложение и Система. Смотри, какие ошибки там вылетают в момент краха языковой панели.
Попробуй после старта системы (до краха языковой панели) убрать из процессов ctfmon, посмотри что изменится.