[cameron]

Как мне в будущем понять, что папка 2 это папка vasya_pupkin`a? »

не могу понять причин по которым это нужно понимать, но всегда можно использовать %userprofile%, которая будет отрабатывать верно.
для создания костылей для решения прошлых костылей нужно понимаать по каким причинам бывает ошибки, для этого нужно смотреть в логах.

да, сделать это в один скрипт, скорее всего не получится, потому что вам нужно физическое создание нового профиля, а это логон.
хотя, наверно можно раскорячиться через RDP логон, логофф, запуск переименования.

скажите, а откуда у вас такие массовые переименования пользователей?