[lxa85]

Набираю 192.168.0.109 в интернет-браузере. Он мне пишет: It works! »

Правильно. Т.к. через интернет браузер идет обращение на 80ый порт по протоколу http, который слушает Apache. Он то и отвечает - все в порядке, я работаю.
Обращение в Windows системах идет по протоколу smb (Server_Message_Block). Для его поддержки в Linux настраивается samba сервер.

Как-то расшарил папку в ресурсах по адресу mnt. Она появилась по адресу сервера. Я туда скопировал файл из windows. Теперь не пойму куда физически я этот файл скопировал на сервере. В папке mnt его нет. »

Как предоставляли совместный доступ? По какому адресу? Как именно копировали?
man updatedb, man locate.