[Nun-Nun]

gora,

Взял произвольный набор хотфиксов:

KB2296199_20101213
KB2360131_20101012
KB2387149_20101011
KB2393802_20110207
KB2412687_20110411
KB2416400_20101213
KB2419632_20110110
KB2423089_20101213
KB2436673_20101213
KB2440591_20101213
KB2443105_20101213
KB2467659_20101210
KB2476687_20110207
KB2478960_20110207
KB2478971_20110207
KB2479628_20110207
KB2479943_20110307
KB2483185_20110207
KB2483614_20110307
KB2485376_20110207
KB2485663_20110411
KB2503658_20110411
KB2506212_20110411
KB2506223_20110411
KB2507618_20110411
KB2508272_20110411
KB2508429_20110411
KB2524375_20110322
KB931125_20101025

Вот что получилось с пустыми папками :

001_KB2387149_20101011
001_KB2440591_20101213
001_KB2483185_20110207
001_KB2506212_20110411
002_KB2360131_20101012
002_KB2443105_20101213
002_KB2485376_20110207
002_KB2506223_20110411
003_KB2419632_20110110
003_KB2479943_20110307
003_KB2507618_20110411
003_KB931125_20101025
004_KB2393802_20110207
004_KB2467659_20101210
004_KB2483614_20110307
004_KB2508272_20110411
005_KB2296199_20101213
005_KB2476687_20110207
005_KB2508429_20110411
005_KB2524375_20110322
006_KB2412687_20110411
006_KB2416400_20101213
006_KB2478960_20110207
007_KB2423089_20101213
007_KB2478971_20110207
007_KB2485663_20110411
008_KB2436673_20101213
008_KB2479628_20110207
008_KB2503658_20110411

Тоже самое и с порядковыми номерами файлов хотфиксов.

P.S.

:: Папка в которой будут созданы пустые папки со сквозной нумерацией (не понял зачем они, но пусть будет)

Я думал, что алгоритм работы батника будет построен таким образом, что сначала исходные папки сортируются-переименовываются, согласно исходной задаче, а потом из них копируются сами хотфиксы, переименованные в соответствии с порядковыми номерами отсортированных папок.