[Sub-Zero]

и драйверпаки и распакованные драйвера »

У меня в распакованном виде в дистрибутиве лежат только masstorage драйвера текстового режима. Остальные запакованы 7z и распаковываются в ходе инсталляции уже на жесткий диск.
Зачем еще должны быть какие-то распакованные драйвера? Они запакованные весят немало а уж распакованные вообще караул!

по твоему логичней навалить все файлы в корень дистрибутива »

Ну это же ты делаешь сборку - ты и должен понимать что в ней к чему, а остальным там делать нечего
Microsoft ведь тоже не плодил кучу папок - а попихал все в одну и потом уже inf файлами они разносятся по директориям кто куда. Так imho правильнее
Хотя если это аддон то для облегчения процесса с папками наверное лучше.