[MKN]

Меня интересует как сделать чтобы именно в процессе установки НЕРО не трогал ассоциации. »

С штатным дистрибутивом Nero, "напрямую" - никак. Так уж разрабы порешили... Но можно в обход.
Не составляет труда отследить изменения в реестре после установки, касаемые ассоциаций. Если такое ассоциирование не нужно, то добавь в дистрибутив обычный рег(или cmd) файл, отменяющий эти ассоциации после установки.

ps Касательно утилит, работающих с ассоциациями файлов, в том числе и упомянутых здесь - все они крайне не удачны, часто "дремучи", а иногда даже и не работоспособны. Особенно в Win7.