[APTEM267]

Вопрос решился.
Проблема была не в вирусе, а в том что на сервере был разрешён доступ к одной папке только для 5 подключений (по умолчанию для windows XP Home, можно проверить командой net config server). После подмены файлов на разлоченые от XP SP2 (на сервере SP3, но работают вроде нормально, без глюков) и полного отключения Windows File Protection на всех компьютерах 1С стал запускаться нормально.
Для XP Pro это ограничение 10 подключений, для windows 7 уже 20, а для серверных версий 16,7 миллиона.