[okshef]

на данный момент он у меня загружается по пути - C:\windows\system32\boot\winload.exe »

Загружается у вас система стандартно:

path \Windows\system32\winload.exe

А вот

По идее загрузчик должен быть в на диске Винды »

все зависит от того, какой смысл вкладывать в эти слова.
Если файл winload.exe - то, да, верно.
Если файл bootmgr - то для выполнения функций загрузки он должен быть на активном разделе, и совпадение с разделом с Windows 7 - всего лишь возможность.
Если MBR и MBS - у них свое строгое расположение.

У вас изменилась активность: классически, активным должен быть раздел "Зарезервировано системой", а у вас - раздел С:
Как это произошло - я не могу сказать.
Думаю, если вы смените активность разделов, хуже не будет. Хотя и сейчас проблем нет.