[Tau_0]

Kotelevskiy,

Как очистить загрузочный сектор не системного диска без потери разделов и информации

Зто просто и тут много мозгов много не надо --- ничто не потеряется, если поймёте--- как ОНО устроено MBS/MBR.
Надо зачистить MBS (а это MBR по большому счёту) --- то есть зачистить сектор ноль…. Там ВСЁ и лежит. А расшифровка здесь… Оченгь давно так это дело придумали.
Таблица разделов GUID --- простенько и со вкусом…
http://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%A2%...%BE%D0%B2_GUID

Сиё есть базовые понятия --- они справедливы для любой OS.

Если OS мешает и лезет под руку (где не надо) ---- берите дисковый редактор и правьте сектор НОЛЬ на харде.

По жизни проще сигнатуру стереть (сигнатура загрузочного секатора 0xAA55 (little-endian) ), чем с заморочками OS разбираться. Но это дело вкуса...