[El Scorpio]

А возможно ли это дело как-то максимально аавтоматизировать? »

Можно написать командный файл и вставить его в автозапуск.
Теоретически, алгоритм этого файла должен быть таким
1. Подключить куст реестра установленной системы к реестру запущенной
2. Экспортировать раздел подключенного реестра в текстовый файл
3. Сделать замену ключей в файле, проверить результат
4. Экспортировать раздел основого реестра в запасной файл и удалить
5. Импортировать раздел основного реестра из текстового файла
6. Проверить работу, если ошибка - импортировать раздел основного реестра из запасного файла