[Beyound]

начнем с простого - п 3. есть отдельный стандартный класс для работы с реестром винды, находится в библиотеке windows.h, подробнее - тут
п.1. системный файл не отличается от обычного файла ничем, просто иногда нужны права админа чтобы его двигать. Опять же в winAPI, таже библиотека, есть стандартные функции на эту тему, подробнее ну скажем тут неплохо все расписано
п.2. для работы с usb тоже скорее всего есть в winAPI чтонить типа перечислителя подключенных устройств, подробнее не скажу, такое не делал а искать лень уже.