[Raistlin]

Запускаются.
Оказалось, что кое-что из Common Startup таки запускается, но не всё. Причем сначала не запускалось больше. В частности, Process Killer на момент создания темы не запускался, а потом (после нескольких релогинов) начал. А Power4 Gear (это ASUS'овский ноутбук) под Administrator'ом по-прежнему можно увидеть в трее только запустив вручную. HP Toolbox (утилита наблюдения для HP LaserJet M1522n) хоть и запускается, но в трее не показывается, а должна. Под остальными пользователями, повторяю, никаких проблем.
Однажды я уже сталкивался с подобной непонятностью - под ограниченной записью из Common Startup не запускался HotSwap!, загружаемый через CPAU.exe. Машина была чужая, так что особо копать возможности не было. И вот опять.