[QRS]

Как мне представляется, то в Вашем случае самый простой способ решения проблемы - руками ограничить торрент клиенты по количеству потоков и по полосе пропускается.

Если же очень хочется все сделать автоматом (программа шейпер), то нужно чтобы весь трафик (от 4х клиентов) шел через сервер-ограничитель либо на L3 (сервер - как шлюз по-умолчанию), либо L4 (прокси) - здесь вопрос поддерживают ли все используемые программы режим прокси.

Если Вы принципиально выбрали платформу W2003, то попробуйте ставить Kerio (6я версия давала ограниченный Trial-период, не знаю есть ли такое в новой - седьмой версии).
Если хотите проще - поставьте IDeco - у него демо-период до 30 дней.

Т.ч. раз в месяц будете переустанавливать. Ideco переустанавливается за 20 минут + минут 10 на настройку... а там есть и антивирус и куча всего... так что настоятельно рекомендую.

Можно конечно пробовать бесплатные решения на FreeBSD, но в этом я, к сожалению, не силен.