[gora]

Попробуйте так:

Код:

@echo off 
SetLocal enabledelayedexpansion
color F
chcp 1251 >nul
title Select REalm

echo ---------------------------------
echo Здравствуйте^^!
echo Пожалуйста, выберите рилм^^!
echo ---------------------------------
Set cnt=0
For /F "tokens=1* delims=," %%i In (var.txt) Do (
	Set /a cnt+=1
	Set l!cnt!=%%j
	echo !cnt! - %%i
)
:_start
set /p choice=Ваш выбор: 
if %choice% GTR %cnt% goto :_start
For /L %%i In (1,1,%cnt%) DO If %choice%==%%i Echo !l%%i!>realmlist.wtf

cls
chcp 866 >nul
pause

Файл var.txt

Код:

Wowcircle.com rait - x15,set realmlist logon.wowcircle.com
Wowcircle.com rait - x30,set realmlist logon2.wowcircle.com
Wowcircle.com rait - x45,set realmlist logon.wow.san.ru

echo>realmlist.wtf set realmlist logon.wowcircle.com »

Что за строка записывается у Вас в файл realmlist.wtf я не понял, но сделал как у Вас.