[Erekle]

Если это вспомогательный диск, то просто удалите.
Что не захочет удалиться, например, файлы Флеш проигрывателя, удалить программой Unlocker (напишет, что связанных потоков не найдено; действия - удалить).
Если планируется иметь этот диск постоянно в корпусе ПК, то восстановление системы на этом диске отключить в настройках Системы в Панели управления. С Корзиной - как хотите.

Но lxa85 прав, конечно. Если диск физически один, на том логическом диске, который хотите оставить под хранилище, нет системы, которая загружается, но имеются файлы, необходимые для загрузки системы, которая на другом логическом диске, тогда удаление этих файлов нельзя.