[kotkovets]

Как все запутано!
Здесь организован бесконечный цикл, до тех пор, пока не появится файлик Txt.txt
Для четвертого запуска app.exe или продолжения скрипта нужно время "жизни" цикла

Код:

!include "LogicLib.nsh"
---
Section -Post
Exec "App1.exe"
Exec "App2.exe"
ReadRegStr $R0 HKLM "SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\App Paths\App3" "Path"
Exec "$R0\App3.exe"
 ${Do}
  StrCpy $0 0
  IfFileExists "$Temp\Txt.txt" 0 +2
  StrCpy $0 1
  ${If} $0 == 1
        Quit
  ${EndIf}
${LoopUntil} $0 == 1

SectionEnd