[IgNat]

если подключить к уже включенному компу »

- в подсоединяли оба кабеля к диску или один из кабелей был подсоединён до включения ПК?

ЗЫ отключал жесткий диск на котором стоит система, оставлял только новый-тоже самое. »

- поясните.

msi k9n ultra »

- дата/версия BIOS.
Оставьте только samsung hd105si 1000 gb (все подсоединения/отсоединения устройств производим только при выключенном ПК! ). Просканируйте (линейное чтение по клавише F4) HDD любой из программ:
MHDD;
Victoria for DOS;
результат сканирования, SMART, паспорт тестируемого HDD выложите здесь. Чтобы не усложнять жизнь объяснениями про лог-файлы, результаты просто сфотографируйте, например телефоном. SMART должен быть виден весь!

Никуда не торопимся, что непонятно спрашиваем.

спалили ЖД скорее всего. »

- вряд ли, в современных HDD достаточная "защита от дураков".

сервисмены увидят это? »

- если же действительно "спалили", то увидят.