[LilLoco]

Ну я как бы с этим тоже не сталкивался, но можно попробовать разобраться с этим! Могу предложить пока что чисто теоретически, т.к. в данный момент нету под рукой C#.
Допустим нужно запустить программу Программа1.exe.

Код:

Process proc = new Process();
proc.StartInfo.FileName = "Программа1.ехе";
proc.Start();
IntPtr hProc = Proc.Handle; //по идее в hProc должен записаться Хэндл, либо я совсем не прав, поправьте если что!

Не забываем про

Код:

using System.Diagnostics

.

Если процессов много запускается, то делаем все для каждого!
Потом, если все таки воспользоваться

WaitForMultipleObject »

, то из всех хэндлов создать массив,либо создавать его сразу, и запускать саму функцию!