[gigi1988]

C этим разобрался. Проблема была в php. Указала в конфиге апача в секции virtualhost для каждого сайта:
php_admin_value open_basedir "/data/sites/site2" (или site1).
Но ситуация теперь такая. Хосты работают от разных пользователей. через команду system() выполняемую на site1 создать каталог в site2 не получается. А через site2 в site1 каталог создается. В чем может быть причина? /data/sites/site1 и /dats/sites/site2 принадлежат соответственно пользователем от имени которых работают хосты (их домашние папки)