[El Sanchez]

Вот в чём может быть проблема? »

Tosyk, вероятно система не может найти путь к psr-tool.exe и tty-tool.exe.
Вариант №2

Код:

@Echo Off
Set Source=C:\Source

For /F "Tokens=*" %%A In ('Dir /B /S "%Source%\*.psr"') Do (
	MD "%%~dpnA" 2>nul&&psr-tool.exe "%%A"
	For %%B In ("%%~dpA*.tty") Do tty-tool.exe "%%B" "%%~dpB_%%~nxB" -option&&Move /Y "%%~dpB_%%~nxB" "%%~dpnA\%%~nxB"
)

psr-tool.exe и tty-tool.exe должны лежать рядом с батником либо в одном из каталогов системной переменной %PATH%