[Admiral]

BoozZzilla для прояснения ситуации неплохо выявить как устроена программа - для этого можно воспользоваться Microsoft Spy++ см. пост за Monday, November 16, 2009 6:06 PM от CookieRevised
Данная программа, запущенна после программы по штрих кодам, даст картину иерархии элементов управления. Зная последнею можно будет воспользоваться функциями FindWindow(Ex) для поиска нужных полей, с дальнейшим забиванием в них с помощью функции SendMessage нужной информации. Эта же функция будет отправлять приложение на печать.

Второй вариант: вооружившись функциями графической библиотеки, например GDI или GdiPlus, создать свою программу печати этикеток.