[megaloman]

sov44, pushd "%Where%" приведёт к тому, что указанная папка будет занята системой, и командой RD удалить её не удастся. Как аналог этого действия,

Код:

Set Where=C:\Tmp

%Where:~0,2%
cd "%Where%"

rd "%Where%" /s /q

В этом примере последовательность команд
C:
cd "C:\tmp"
приведёт к тому, что директория C:\Tmp будет занята и командой RD удалена не будет, хотя её содержимое будет вычищено.
Вариант с Pushd мне нравится больше как более универсальный