[andrew71]

Nun-Nun, а чем не устраивает .ini файл, лежащий в каталоге ImgBurn? Так проще и возможности более гибкие. Тем более, если на компьютере несколько пользователей может возникнуть небольшая проблема переноса настроек в различные профили, т.к. настройки хранятся в HKCU.
Но если хотите через реестр, то .reg файл лучше всего преобразовать в .ini и полученным дополнить imgburn.inf.
Инструкции как это делается можно почитать на форуме.

Где он должен лежать, рядом с файлом ImgBurn.exe или внутри него? ?

Это зависит от Вашего желания. Можно сделать и внутри и рядом.

Команда RunProgram="REGEDIT /S ImgBurn.reg" должна быть прописана в конфигурационном файле ImgBurn.txt, полученном при разборке ImgBurn.exe с помощью кнопки 7-Zip SFX, или я не прав?

Если снаружи, то REGEDIT /S ImgBurn.reg должна быть прописана в RUN отдельной строкой с переводом строки в конце.
Если файл ImgBurn.reg будет внутри, то так как Вы пишете.